公积金二次贷款利率比第一次要高。公积金首次贷款执行公积金贷款基准利率，第二次贷款执行基准利率的1.1倍。因此，用户贷款买首套房，能申请公积金贷款尽量优先申请公积金贷款，至于第二套房是否要申请公积金贷款，则以实际情况为准。
由于公积金贷款利率要低于商业贷款利率，因此公积金贷款有额度限制。当公积金贷款额度不足时，用户可以尝试申请组合贷款，组合贷款是同时申请公积金贷款与商业贷款，公积金贷款额度不足的部分由商贷来补足。不符合公积金贷款条件，用户只能申请商业的贷款。
公积金贷款的门槛较高，如果无法申请公积金贷款，申请商业贷款也是可以的。公积金贷款放款后，请注意按时归还每期房贷。
公积金第二次贷款注意事项
1、贷款人必须要结清上一次的贷款才可以申请第二次公积金贷款;
2、第二次公积金贷款必须在借款人退休后五年内还清，即男性贷款年龄和期限不得超过65，女性不得超过60;
3、贷款人必须资信良好，具备稳定还款能力;
4、在申请二次贷款时账户最少要有6个月的公积金缴纳额度;
5、满足当地公积金管理中心第二次贷款的其他条件。
申请公积金贷款需要综合资质满足当地公积金中心的要求，客户在正式按揭以前可以先咨询公积金中心，了解清楚具体的贷款要求，做到心中有数以后再去尝试贷款。
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