少部分地区将新冠核酸检测项目临时纳入了医保诊疗目录，按乙类支付，例如湖北省，但大多数地区医保目录中不含核酸检测费用，因此不能用医保统筹基金报销，但是可以刷医保卡支付费用，需满足以下条件：
1、是城镇职工基本医保参保人；
2、医保个人账户余额充足；
3、在可以刷医保卡的医疗机构进行检测，若核酸检测医疗机构点不能刷医保卡的话，则无法支付。
由于城乡居民医保没有个人账户，因此这部分参保人发生的核酸检测费用需自己支付。另外还需注意的是，在医疗机构挂号的费用也是要自己出的。各地区的核酸检测费用都不一样，一般公立医院每次费用在60-100元左右，可以拨打医疗机构客服热线咨询。核酸检测采样后，通常可以在一天内出结果。
有的网表示，部分地区住院或发热门诊就诊的发热患者及陪护人员有一次免费的核酸检测，具体以医疗机构规定为准。
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