1、初审申报：参保单位或参保个人首次申请须在每季度最后一个月15日以前，凭《医保手册》到初审医院医保科领取表格并完整填写《特殊病种门诊申请表》，同时备齐申报病种的相关病历资料（或复印件）、一张近期1寸免冠照片，选定一家定点医院和一家特殊病种门诊服务药店就医、购药。异地安置人员特门申报由单位医保专干或本人到本市本级特门初审鉴定医院医保科办理相关手续。
2、医院初审：初审医院收齐申请人的相应资料后，组织本院医疗专家诊查并初步鉴定。
3、专家评审：市医疗保险处每季季末组织本市城镇职工基本医疗保险专家委员会进行集中评审，专家委员会根据特门确认标准进行逐个审定。
4、发放《特殊病种门诊专用病历》：经市专家委员会评审通过的，特门申请人在下个季度第一个5个工作日以后，携带《医保手册》到市医疗保险处领取《特殊病种门诊专用病历》评审通过者于当月开始享受基本医疗保险特殊病种门诊待遇。经市专家委员会评审未通过的，注明未批准的原因并书面告知，同时将病历资料退回申请人。
5、特殊病种续办程序：特殊病种门诊A、B类有效期为两年，C类有效期为一年。病情未愈须继续治疗的，需要办理续办手续。
二、医疗补助金的标准
失业人员在领取失业保险金期间患病，根据其失业前累计缴纳失业保险费的时间，可以补助本人应领取失业保险金总额60%—80%的医疗补助金。具体标准是：
（1）累计缴费时间不满5年的，按照医疗费的60%给予补助;但累计补助金额，最高不超过本人应领取失业保险金总额的60%；
（2）累计缴费时间满5年不满10年的，按照医疗费的65%给予补助;但累计补助金额，最高不超过本人应领取失业保险金总额的65%；
（3）累计缴费时间满10年不满15年的，按照医疗费的70%给予补助;但累计补助金额，最高不超过本人应领取失业保险金总额的70%；
（4）累计缴费时间满15年不满20年的，按照医疗费的75%给予补助;但累计补助金额，最高不超过本人应领取失业保险金总额的75%；
（5）累计缴费时间满20年以上的，按照医疗费的80%给予补助;但累计补助金额，最高不超过本人应领取失业保险金总额的80%。
三、医疗补助金的支付条件
医疗补助金的支付条件领取一次性医疗补助金须同时具备以下各项：
（一）劳动者与用人单位之间存在劳动合同关系，用人单位已依法为劳动者缴纳工伤保险费;
（二）劳动者患病或所受伤害已被依法认定为工伤;
（三）劳动者因工致残，已由劳动能力鉴定部门鉴定为五级至十级伤残;
（四）劳动关系经以下两种法定情况而解除或者终止①五、六级伤残的劳动者本人提出;②七级至十级伤残的由劳动者本人提出或者其劳动、聘用合同期满;
（五）支付具体标准由省、自治区、直辖市人民政府规定后，由工伤保险基金支付。工伤职工领取一次性工伤医疗补助金和伤残就业补助金后，工伤保险关系终止。