我国的基本医疗保险分为城乡居民基本医疗保险、城镇职工基本医疗保险两大社会医疗保险，都是由各级医疗保相关部门管理和经办的医疗保险，但由于二者属于不同的基本医疗保险制，所以差别还是比较大的。
第一，这是两种不同性质的基本医疗保险。
城乡居民基本医疗保险，主要的参保对象为没有参加城镇职工基本医疗保险的其他城乡居民。居民医疗保险的目的，是以大病统筹为目标，只有统筹账户，没有个人账户，每年缴费为300多元，其中有的地方为了不同需要的群体，设置了一档和二档缴费标准，增加了大病补充医疗保险等内容，所以参保费用会超过我国法定的最低缴纳费用。
城镇职工基本医疗保险，主要的参保对象是城镇在岗职工，采取单位和职工按比例缴费的方式，以职工本人的实际工资作为缴费基数，按照统账结合的方式来进行管理，既有统筹账户，也有个人账户。灵活就业人员没有参加城乡居民养老保险的，可以以个人身份缴纳职工基本医疗保险，享受和在职职工一样的医疗保险待遇。
第二，这是两种待遇不同的医疗保险。
城乡居民基本医疗保险，是我国参保人数最多的基本医疗保险，采用我国补助和个人缴费相结合的缴费方式，我国出大头，个人出小头，确保医疗保险基金积累的持续性和稳定性，确保参保人的人员的医疗费用能按时足额支付。
城乡居民医疗保险是按照年度进行缴费，每年的9月1日到12月25日为集中缴费的阶段，实行缴费一年享受一年的待遇，当年没有缴纳医疗保险的，不享受医疗报销的待遇。由于居民医疗保险只有统筹基金，没有个人账户，所以居民医疗保险待遇有三个方面。
一是住院报销的待遇；二是办理了特殊门诊、慢性病门诊认定，在门诊看病的报销待遇；三是重大疾病自费金额超过起付标准以上，按比例报销费用的待遇。
职工基本医疗保险是按月缴费，总的缴费比例为8%以上，其中个人缴费比例为2%，除了统筹账户以外，还要建立个人账户。个人账户资金主要来源于个人缴费的2%，按照缴费基数返还到个人社保卡，主要待遇也是三个方面。
一是门诊费用的待遇，由个人账户进行支付，在医疗共济机制建立和实施的地方，还可以按比例报销门诊费用，由统筹基金支付；二是住院费用的报销待遇；三是特殊门诊疾病、慢性病的报销待遇。
第三，职工医保和居民医保的比较优势。
由于职工医保的缴费标准大幅度高于居民医保，待遇参保比居民医保更具有优势。
一是职工医保可以报销门诊费用；居民医保没有门诊费用。
二是职工医保比居民医保报销比例更高。以三甲医院为例，职工医保的报销比例为80%以上；居民医保的报销比例为50%左右。
三是居民医保需要终身缴费才能持续享受医保待遇；职工医保在退休时，如果缴费年限达到法定的最低缴费年限，不再缴纳医疗保险，退休后终身享受医疗保险。
四是职工医保的最高支付限额大幅度高于居民医保的最高支付限额。
所以，一年三四百元的居民医保和五千元左右的职工医保相比，二者体现的是两种性质不同的基本医疗保险制，除了缴费标准的差异以外，在缴费方式、报销待遇、账户管理、门诊费用、待遇享受、最高支付限额等方面都存在很大的区别。
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